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INSTITUT DE BIOLOGIE DE L'ÉCOLE NORMALE SUPÉRIEURE

Équipements

La plateforme génomique de l’Institut de Biologie de l’École normale supérieure (IBENS) regroupe l’ensemble des appareils nécessaire à la réalisation du séquençage à haut débit en génomique fonctionnelle. Ces machines sont accessibles à tous les laboratoires et entreprises privées qui le souhaitent soit en accès libre pour les machines les moins sensibles, soit sous la forme d’une collaboration ou après le suivi d’une formation pour les appareils plus complexes.

 

Réservation des appareils de la plateforme

La plateforme dispose d'un calendrier de réservation de façon à gerer l'accès aux appareils disponibles en libre service.

Pour y avoir accès vous pouvez cliquer ici ou passer par le menu de droite.

Analyses à haut débit

Séquenceur à Haut débit – NextSeq 500

  • Fabricant : Illumina
  • Installation : avril 2015
  • Séquençage de jusqu’à 400 millions de lectures en parallèle. Séquençage en mode haut ou moyen débit de lectures de 75 bases de long jusqu’à 2x 150 bases de long.
  • Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.

Séquenceur à Haut débit – MinION

  • Fabricant : Oxford Nanopore Technologies
  • Installation : mai 2016
  • Séquencage de longues lectures pour le RNA-Seq.
  • Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.

qPCR à Haut Débit – Biomark HD system

  • Fabricant : Fluidigm
  • Installation : avril 2013
  • Système de PCR quantitative à Haut Débit par microfluidique.
  • Accès : contacter la plateforme de qPCR-HD par courrier électronique qpcr@biologie.ens.fr ou en allant sur leur site web.

Lecteur d’absorbance en plaque – SpectraMax Plus384

  • Fabricant : Molecular Devices
  • Installation : avril 2000
  • Système utilisé entre autre pour la quantification des produits de PCR amplifiés.
  • Accès : libre sur réservation pour les académiques après formation par le personnel de la plateforme.

Préparation des échantillons

Ultra-sonicateur – S220

  • Fabricant : Covaris
  • Installation : juin 2013
  • Sonication grâce à une onde ciblée des échantillons de façon homogène et sans réchauffement. Permet entre autre la fragmentation des banques pour le séquençage à haut débit et celui de l’ADN pour les expériences d’immuno-précipitations.
  • Accès : libre sur réservation pour les académiques après formation par le personnel de la plateforme. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Contrôle qualité

Électrophorèse capillaire – Fragment Analyzer

  • Fabricant : Agilent / Advanced Analytical
  • Modèle; : 12 capilaires
  • Installation : janvier 2018
  • Contrôle qualité des échantillons d’ADN et d’ARN dans un petit volume jusqu'à 96 échantillons. Possibilité d'utiliser 3 plaques 96 puits.
  • Accès : libre sur réservation pour les académiques après formation par le personnel de la plateforme. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Électrophorèse capillaire – Bioanalyzer 2100

  • Fabricant : Agilent
  • Installation : janvier 2002
  • Contrôle qualité des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
  • Accès : libre sur réservation pour les académiques après formation par le personnel de la plateforme. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Spectrophotomètre à UV – Nanodrop ND-1000

  • Fabricant : NanoDrop Technologies
  • Installation : mars 2006
  • Contrôle qualité des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
  • Accès : libre pour les académiques.

Fluorimètre – QuBit 3.0

  • Fabricant : Life Technologies
  • Installation : mai 2017
  • Quantification des échantillons d’ADN, ARN et protéines en petite quantité.
  • Accès : libre pour les académiques.