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Le MinION Mk1D est le nouvel appareil MinION pour le séquençage des ARNm pleine longueur. Il remplace les séquenceurs MiNION Mk1B et Mk1C.

Le PromethION P2 solo est le nouveau séquenceur d'Oxford Nanopore Technologies. Il permet de séquencer plus de 100 millions de lectures d'ADNc pour l'étude des isoformes ou 100-200 Gbases d'ADN génomique par run.

Notre nouveau séquenceur lectures courtes Illumina NextSeq 2000 est désormais rentré en production. Cette nouvelle machine permet de séquencer jusqu’à 1,1 milliards de lectures en parallèle, soit plus du double que notre précédent séquenceur NextSeq 500. Ces lectures obtenues vont de 50 bases jusqu’à 2 x 150 bases de long.

Nous remercions le fond SESAME de la région Ile de France, le GIS IBiSA ainsi que Actions incitatives de l'École normale supérieure pour leur aide dans le financement de cet équipement.

Le Mk1C est le nouvel appareil MinION pour le séquençage des ARNm pleine longueur. Il dispose désormais d'une capacité de stockage de 1 To et d'un écran de contrôle permettant un meilleur contrôle de l'appareil.

Afin de célébrer les 20 ans de la plateforme génomique, nous organisons le 28 mars 2019 à Paris une demi-journée appelée “20 years of genomics past and future directions”. Cet évenemment rassemblera une série de conférences à propos des axes de recherche en génomique. Un point sur le passé sera fait et nous parlerons de l'avenir du domaine. L'après-midi sera suivie d'une réception au Musée d'Orsay avec une visite guidée et un dîner de gala.

Compagnon du séquenceur MinION, il permet de contrôler le séquenceur (grâce au logiciel MinKNOW) et de traiter l’information de sortie du séquençage jusqu’à l’appel de base. Il va servir à améliorer le traitement des données de séquençage des ARNm pleine longueur.

Découvrez les derniers développements technologiques d'Oxford Nanopore et les derniers projets innovants des utilisateurs français utilisant cette technologie au Nanopore Day Paris le 15 mars 2018. Cette journée est organisée par  Oxford Nanopore Technologies et la plateforme génomique de l'IBENS. Pour plus d’information et vous inscrire gratuitement rendez-vous sur le site de la journée.

Un nouvel appareil est arrivé sur la plate-forme : un Chromium  de 10X Genomics. Ce nouveau matériel dédié au RNA-seq sur cellule unique est actuellement en cours de test.

Nous avons reçu le séquenceur MinION de la société Oxford Nanopore et nous allons effectuer des tests de séquençage des ARNm pleine longueur.

Après de nombreux mois de travail, la nouvelle version du site internet de la plateforme génomique de l'Institut de Biologie de l'École normale supérieure (IBENS) est en ligne. Elle remplace et mets à jour notre ancien site qui avait été créé en 2003. N'hésitez pas à parcourir les différents onglets pour découvrir nos activités.